文部省 科学研究費補助金 新学術領域研究 植物発生ロジックの多元的開拓

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発表論文

班員名 塚谷裕一
著者名 Hisanaga T, Kawade K, *Tsukaya H
タイトル Compensation: a key to clarifying the organ-level regulation of lateral organ size in plants.
出版年 2015
掲載 J. Exp. Bot. 66: 1055-1063.
班員名 塚谷裕一
著者名 Guo P, Yoshimura A, Ishikawa N, Yamaguchi T, Guo Y, *Tsukaya H
タイトル Comparative analysis of the RTFL peptide family on the control of plant organogenesis.
出版年 2015
掲載 J. Plant Res. 128: 497-510.
班員名 塚谷裕一
著者名 Fukushima K, Fujita H, Yamaguchi T, Masayoshi K, Tsukaya H, *Hasebe M
タイトル Oriented cell division shapes carnivorous pitcher leaves of Sarracenia purpurea.
出版年 2015
掲載 Nature Commun. 6: 6450.
班員名 塚谷裕一
著者名 Tsukaya H
タイトル  Comparative leaf development in angiosperms.
出版年 2014
掲載 Curr. Opin. Plant Biol. 17: 103-109.
班員名 塚谷裕一
著者名 Maeda S, Gunji S, Hanai K, Hirano T, Kazama Y, Ohbayashi I, Abe T, Sawa S, Tsukaya H, *Ferjani A
タイトル The conflict between cell proliferation and expansion primarily affects stem organogenesis in Arabidopsis.
出版年 2014
掲載 Plant Cell Physiol. 55: 1994-2007.
班員名 塚谷裕一
著者名 Hisanaga T, Ferjani A, Horiguchi G, Ishikawa N, Fujikura U, Kubo M, Demura T, Fukuda H, Ishida T, Sugimoto K, *Tsukaya H
タイトル ATM-dependent DNA damage response acts as an upstream trigger for compensation in fasciata1 during Arabidopsis leaf development.
出版年 2013
掲載 Plant Physiol. 162: 831-841.
班員名 深城英弘
著者名 Voß U, Wilson MH, Kenobi K, Gould PD, Robertson FC, Peer WA, Lucas M, Swarup K, Casimiro I, Holman TJ, Wells DM, Péret B, Goh T, Fukaki H, Hodgman TC, Laplaze L, Halliday KJ, Ljung K, Murphy AG, Hall AJ, Webb AAR, *Bennett MJ
タイトル Lateral root organ initiation re-phases the circadian clock in Arabidopsis thaliana.
出版年 2015
掲載 Nature Commun. 6:7641
班員名 深城英弘
著者名 Lavenus J, Goh T, Guyomarc'h S, Hill K, Lucas M, Voss U, Kenobi K, Wilson M, Farcot E, Hagen G, Guilfoyle TJ, Fukaki H, *Laplaze L, *Bennett MJ
タイトル Inference of the Arabidopsis lateral root gene regulatory network reveals a bifurcation mechanism that defines primordia flanking and central zones.
出版年 2015
掲載 Plant Cell 27: 1368-1388.
班員名 深城英弘
著者名 Ushio M, Yaasaki E, Takusu H, Nagano AJ, Fujinaga S, Honjo MN, Ikemoto M, Sakai S, Kudoh H
タイトル Microbail communities on flower surfaces act as signatures of pollinator visitation.
出版年 2015
掲載 Sci. Rep. 5: 8695.
班員名 深城英弘
著者名 Cabrera, J, Díaz-Manzano, FE, Sanchez, M, Rosso, MN, Melillo, T, Goh T, Fukaki, H, Cabello, S, Hofmann, J, Fenoll, C, Escobar, C.
タイトル Xylem pole pericycle cells are crucial for gall and giant cell development during Arabidopsis and root-knot nematodes interaction, providing molecular links to lateral root formation.
出版年 2014
掲載 New Phytologists 203: 632-645.
班員名 深城英弘
著者名 Satake A, Kawagoe T, Sabiri Y, Chiba Y, Sakurai G, Kudoh H
タイトル Forecasting flowering phenology under climate warming by modelling the regulatory dynamics of flowering-time genes.
出版年 2013
掲載 Nature Commun. 4: 2303.
班員名 伊藤恭子
著者名 Ohashi-Ito K, Saegusa M, Iwamoto K, Oda Y, Katayama H, Kojima M, Sakakibara H, *Fukuda H
タイトル A bHLH complex activates vascular cell division via cytokinin action in root apical meristem.
出版年 2014
掲載 Curr Biol. 24: 2053-2058.
班員名 伊藤恭子
著者名 Ohashi-Ito K, Fukuda H
タイトル Xylem.
出版年 2014
掲載 Curr Biol. 24: R1149.
班員名 伊藤恭子
著者名 Kondo Y, Ito T, Nakagami H, Hirakawa Y, Saito M, Tamaki T, Shirasu K, Fukuda H
タイトル Plant GSK3 proteins regulate xylem cell differentiation downstream of TDIF–TDR signalling.
出版年 2014
掲載 Nat. Commun. 5: 3504.
班員名 伊藤恭子
著者名 Ohashi-Ito K, *Fukuda H
タイトル Initiation of vascular development.
出版年 2014
掲載 Physiol Plant 151: 142-146.
班員名 荒木崇
著者名 Kawamoto N, Sasabe M, Endo M, Machida Y, *Araki T
タイトル Calcium-dependent protein kinases responsible for the phosphorylation of a bZIP transcription factor FD crucial for the florigen complex formation.
出版年 2015
掲載 Sci. Rep. 5: 8341.
班員名 荒木崇
著者名 Endo M, Shimizu H, Nohales MA, Araki T, Kay SA
タイトル Tissue-specific clocks in Arabidopsis show asymmetric coupling.
出版年 2014
掲載 Nature 515: 419-422.
班員名 荒木崇
著者名 Endo M*, Kudo D, Koto T, Shimizu H, *Araki T
タイトル Light-dependent destabilization of PHL in Arabidopsis.
出版年 2014
掲載 Plant Signal. Behav. 9: e28118.
班員名 荒木崇
著者名 Niwa M, Endo M, *Araki T
タイトル Florigen is involved in axillary bud development at multiple stages in Arabidopsis.
出版年 2013
掲載 Plant Signal. Behav. 8: e27167.
班員名 荒木崇
著者名 Endo M, Tanigawa Y, Murakami T, *Araki T, *Nagatani A
タイトル PHYTOCHROME-DEPENDENT LATE-FLOWERING accelerates flowering through physical interactions with phytochrome B and CONSTANS.
出版年 2013
掲載 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110: 18017-18022.
班員名 柿本辰男
著者名 Müller D, Waldie T, Miyawaki K, To J, Melnyk C, Kieber J, Kakimoto T, Leyser O
タイトル Cytokinin is required for escape but not release from auxin mediated apical dominance. 
出版年 2015
掲載 Plant J. 82: 874-886.
班員名 柿本辰男
著者名 Kumari A, Jewaria P, Bergmann D, Kakimoto T
タイトル Arabidopsis Reduces Growth Under Osmotic Stress by Decreasing SPEECHLESS Protein.
出版年 2014
掲載 Plant Cell Physiol. 55: 2037-2046.
班員名 柿本辰男
著者名 Tanaka H, Nodzyłski T, Kitakura S,Feraru MI, Sasabe M, Ishikawa T, Kleine-Vehn J, Kakimoto T, Friml J.
タイトル BEX1/ARF1A1C is Required for BFA-Sensitive Recycling of PIN Auxin Transporters and Auxin-Mediated Development in Arabidopsis.
出版年 2014
掲載 Plant Cell Physiol. 55: 737-749.
班員名 柿本辰男
著者名 Shimizu-Mitao Y, *Kakimoto T
タイトル Auxin Sensitivities of All Arabidopsis Aux/IAAs for Degradation in the Presence of Every TIR1/AFB.
出版年 2014
掲載 Plant Cell Physiol. 55: 1450-1459.
班員名 柿本辰男
著者名 Tanaka H, Kitakura S, Rakusová H, Uemura T, Feraru MI, De Rycke R, Robert S, Kakimoto T, *Friml J.
タイトル Cell polarity and patterning by PIN trafficking through early endosomal compartments in Arabidopsis thaliana.
出版年 2013
掲載 PLoS Genet. 9: e1003540.
班員名 中島敬二
著者名 Tatematsu K, Toyokura K, Miyashima S, Nakajima K, *Okada K
タイトル A molecular mechanism that confines the activity pattern of miR165 in Arabidopsis leaf primordia.
出版年 2015
掲載 Plant J. 82:596-608.
班員名 中島敬二
著者名 Zhou Y, Honda M, Zhu H, Zhang Z, Guo X, Li T, Li Z, Peng X, Nakajima K, *Duan L, *Zhang X
タイトル Spatiotemporal Sequestration of miR165/166 by Arabidopsis Argonaute10 Promotes Shoot Apical Meristem Maintenance.
出版年 2015
掲載 Cell Rep. 10: 1819–1827.
班員名 中島敬二
著者名 Hisanaga T, Miyashima S, *Nakajima K
タイトル Small RNAs as positional signal for pattern formation.
出版年 2014
掲載 Curr Opin. Plant Biol. 21:37-42.
班員名 中島敬二
著者名 Ursache R, Miyashima S, Chen Q, Vatén A, Nakajima K, Carlsbecker A, *Zhao Y, *Helariutta Y, *Dettmer J.
タイトル Tryptophan-dependent auxin biosynthesis is required for HD-ZIP III-mediated xylem patterning.
出版年 2014
掲載 Development 141:1250-1259.
班員名 中島敬二
著者名 Furuta KM, Yadav SR, Lehesranta S, Belevich I, Miyashima S, Heo JO, Vatén A, Lindgren O, De Rybel B, Van Isterdael G, Somervuo P, Lichtenberger R, Rocha R, Thitamadee S, Tähtiharju S, Auvinen P, Beeckman T, *Jokitalo E, *Helariutta Y. 
タイトル Plant development. Arabidopsis NAC45/86 direct sieve element morphogenesis culminating in enucleation. 
出版年 2014
掲載 Science 345: 933-937.
班員名 平野博之
著者名 Tanaka W, Ohmori Y, Ushijima T, Matsusaka H, Matsushita T, Kumamaru T, Kawano S, *Hirano H-Y
タイトル Axillary meristem formation in rice requires the WUSCHEL ortholog TILLERS ABSENT1.
出版年 2015
掲載 Plant Cell 27: 1173-1184.
班員名 平野博之
著者名 Toriba T, *Hirano H-Y
タイトル The DROOPING LEAF and OsETTIN2 genes promote awn development in rice.
出版年 2014
掲載 Plant J. 77: 616-626.
班員名 平野博之
著者名 Sato D-S, Ohmori Y, Nagashim H, Toriba T, *Hirano H-Y
タイトル A role for TRIANGULAR HULL1 in fine-tuning spikelet morphogenesis in rice.
出版年 2014
掲載 Genes Genet.Syst. 89: 61-69.
班員名 平野博之
著者名 Ohmori Y, Yasui Y, *Hirano H-Y
タイトル Overexpression analysis suggests that FON2-LIKE CLE PROTEIN1 is involved in rice leaf development.
出版年 2014
掲載 Genes Genet. Syst. 89: 87-91.
班員名 平野博之
著者名 Ishiwata A, Ozawa M, Nagasaki H, Kato M, Noda Y, Yamaguchi T, Nosaka M, Shimizu-Sato S, Nagasaki A, Maekawa M, Hirano H-Y, *Sato Y
タイトル Two WUSCHEL-related homeobox genes, narrow leaf2 and narrow leaf3, control leaf width in rice.
出版年 2013
掲載 Plant Cell Physiol. 54: 779-792.
班員名 河内孝之
著者名 Eklund DM, Ishizaki K, Flores-Sandoval E, Kikuchi S, Takebayashi Y, Tsukamoto S, Hirakawa Y, Kato H, Kouno M, Bhalerao RP, Lagercrantz U, Kasahara H, Kohchi T, *Bowman JL
タイトル Auxin Produced by the Indole-3-Pyruvic Acid Pathway Regulates Development and Gemmae Dormancy in the Liverwort Marchantia polymorpha.
出版年 2015
掲載 Plant Cell 27:1650-1669.
班員名 河内孝之
著者名 Kato H, Ishizaki K, Kouno M, Shirakawa M, Bowman J L, Nishihama R, *Kohchi T
タイトル Auxin-mediated transcriptional system with a minimal set of components is critical for morphogenesis through the life cycle in Marchantia polymorpha.
出版年 2015
掲載 PLoS Genetics 11:e1005084.
班員名 河内孝之
著者名 Kubota A, Kita S, Ishizaki K, Nishihama R, Yamato KT, *Kohchi T
タイトル Co-option of a photoperiodic growth-phase transition system during land plant evolution.
出版年 2014
掲載 Nature Commun. 5: 3668.
班員名 河内孝之
著者名 Komatsu A, Terai M, Ishizaki K, Suetsugu N, Tsuboi H, Nishihama R, Yamato KT, Wada M, *Kohchi T
タイトル Phototropin encoded by a single-copy gene mediates chloroplast photorelocation movements in the liverwort Marchantia polymorpha L.
出版年 2014
掲載 Plant Physiol. 166: 411-427.
班員名 河内孝之
著者名 Shirakawa M, Ueda H, Shimada T, Kohchi T, *Hara-Nishimura I
タイトル Myrosin cell development is regulated by endocytosis machinery and PIN1 polarity in leaf primordia of Arabidopsis thaliana.
出版年 2014
掲載 Plant Cell 26: 4462-4482.
班員名 河内孝之
著者名 Ishizaki K, Mizutani M, Shimamura M, Masuda A, Nishihama R, *Kohchi T
タイトル Essential role of the E3 ubiquitin ligase NOPPERABO1 in schizogenous intercellular space formation in the liverwort Marchantia polymorpha.
出版年 2013
掲載 Plant Cell 25: 4075-4084.
班員名 平井優美
著者名 Hayakawa Y, Tachikawa M, *Mochizuki A
タイトル Mathematical study for the mechanism of vascular and spot patterns by auxin and PIN dynamics in plant development. 
出版年 2015
掲載 J. Theor. Biol. 365: 12-22.
班員名 平井優美
著者名 Mochizuki A, Fiedler B
タイトル Sensitivity of chemical reaction networks: a structural approach. 1. Examples and the carbon metabolic network.
出版年 2015
掲載 J. Theor. Biol. 367: 189-202.
班員名 平井優美
著者名 Kusuda H, Koga W, Kusano M, Oikawa A, Saito K, Hirai MY, *Yoshida KT
タイトル Ectopic expression of myo-inositol 3-phosphate synthase induces a wide range of metabolic changes and confers salt tolerance in rice. 
出版年 2015
掲載 Plant Science 232: 49-56.
班員名 平井優美
著者名 Sato Y, Kawagoe T, Sawada Y, Hirai MY, Kudoh H
タイトル Frequency-dependent herbivory by a leaf beetle, Phaedon brassicae, on hairy and glabrous plants of Arabidopsis halleri subsp gemmifera.
出版年 2014
掲載 Evolutionary Ecology 28: 545-559.
班員名 平井優美
著者名 Kawade K, Horiguchi G, Ishikawa N, Hirai MY, Tsukaya H
タイトル Promotion of chloroplast proliferation upon enhanced post-mitotic cell expansion in leaves.
出版年 2013
掲載 BMC Plant Biol. 13: 143.
班員名 伊藤純一
著者名 Yoshikawa T, Ito M, Sumikura T, Nakayama A, Nishimura T, Kitano H, Yamaguchi I, Koshiba T, Hibara K, Nagato Y, Itoh J 
タイトル The rice FISH BONE gene encodes a tryptophan aminotransferase, which affects pleiotropic auxin-related processes.
出版年 2014
掲載 Plant J. 78: 927–936.
班員名 伊藤正樹
著者名 Kobayashi K, Suzuki T, Iwata E, Nakamichi N, Suzuki T, Chen P, Ohtani M, Ishida T, Hosoya H, Müller S, Leviczky T, Pettkó-Szandtner A, Darula Z, Iwamoto A, Nomoto M, Tada Y, Higashiyama T, Demura T, Doonan JH, Hauser MT, Sugimoto K, Umeda M, Magyar Z, Bögre L, *Ito M 
タイトル Transcriptional repression by MYB3R proteins regulates plant organ growth.
出版年 2015
掲載 EMBO J. 34: 1992-2007.
班員名 伊藤正樹
著者名 Maruyama D, Völz R, Takeuchi H, Mori T, Igawa T, Kurihara D, Kawashima T, Ueda M, Ito M, Umeda M, Nishikawa S, Groß-Hardt R, Higashiyama T
タイトル Rapid elimination of the persistent synergid through a cell-fusion for polytubey block.
出版年 2015
掲載 Cell 161:907-918.
班員名 小田祥久
著者名 Oda Y
タイトル Cortical microtubule rearrangements and cell wall patterning.
出版年 2015
掲載 Front Plant Sci. 6: 236.
班員名 小田祥久
著者名 Oda Y, Iida Y, Nagashima Y, Sugiyama Y, Fukuda H
タイトル Novel Coiled-Coil Proteins Regulate Exocyst Association with Cortical Microtubules in Xylem Cells via the Conserved Oligomeric Golgi-Complex 2 Protein.
出版年 2015
掲載 Plant Cell Physiol. 56: 277-286.
班員名 小島晶子
著者名 Machida C, Nakagawa A, Kojima S, Takahashi T, Machida Y
タイトル The complex of ASYMMETRIC LEAVES (AS) proteins plays a central role in antagonistic interactions of genes for leaf polarity specification in Arabidopsis.
出版年 2015
掲載 WIREs Devel. Biol. 4: 655-671.
班員名 篠原秀文
著者名 Tabata R, Sumida K, Yoshii T, Ohyama K, Shinohara H, *Matsubayashi Y
タイトル Perception of root-derived peptides by shoot LRR-RKs mediates systemic N-demand signaling.
出版年 2014
掲載 Science 346: 343-346.
班員名 篠原秀文
著者名 Shinohara H, Matsubayashi Y
タイトル Reevaluation of the CLV3-receptor interaction in the shoot apical meristem: dissection of the CLV3 signaling pathway from a direct ligand-binding point of view.
出版年 2015
掲載 Plant J. 82: 328-336.
班員名 田岡健一郎
著者名 Tsuji H, Tachibana C, Tamaki S, Taoka K, Kyozuka J, Shimamoto K
タイトル Hd3a promotes lateral branching in rice. 
出版年 2015
掲載 Plant J. 82: 256-266.
班員名 高橋卓
著者名 Tong W, Yoshimoto K, Kakehi JI, Motose H, Niitsu M, *Takahashi T
タイトル Thermospermine modulates expression of auxin-related genes in Arabidopsis.
出版年 2014
掲載 Front. Plant Sci. 5: 94.
班員名 高橋卓
著者名 Kakehi JI, Kawano E, Yoshimoto K, Cai Q, Imai A, *Takahashi T
タイトル Mutations in ribosomal proteins, RPL4 and RACK1, suppress the phenotype of a thermospermine-deficient mutant of Arabidopsis thaliana.
出版年 2015
掲載 PLoS One 10: e0117309.
班員名 高橋直紀
著者名 Takahashi N, *Umeda M 
タイトル Cytokinins promote onset of endoreplication by controlling cell cycle machinery.
出版年 2014
掲載  Plant Signal Behav. 9: e29396.
班員名 高橋直紀
著者名 Yi D, Kamei CLA, Cools T, Vanderauwera S, Takahashi N, Okushima Y, Eekhout T, Yoshiyama KO, Larkin J, Van den Daele H, Conklin P, Britt A, Umeda M, *De Veylder L.
タイトル The Arabidopsis thaliana SIAMESE-RELATED cyclin-dependent kinase inhibitors SMR5 and SMR7 control the DNA damage checkpoint in response to reactive oxygen species.
出版年 2014
掲載 Plant Cell 26: 296-309.
班員名 鳥居啓子
著者名 Cui H, Kong D, Wei P, Hao Y, Torii KU, Lee JS, Li J 
タイトル SPINDLY, ERECTA, and its ligand STOMAGEN have a role in redox-mediated cortex proliferation in the Arabidopsis root.
出版年 2014
掲載 Mol Plant. 7: 1727-1739.
班員名 鳥居啓子
著者名 Aguilar-Martínez JA, Uchida N, Townsley B, West DA, Yanez A, Lynn N, Kimura S, *Sinha N
タイトル Transcriptional, post-transcriptional and post-translational regulation of STM gene expression in Arabidopsis determine gene function in the shoot apex.
出版年 2015
掲載 Plant Physiol., 167: 424-442.
班員名 濱田隆宏
著者名 Motomura K, Le Q TN, Hamada T, Kutsuna N, Mano S, Nishimura M, *Watanabe Y
タイトル Diffuse DCP2 Accumulates In DCP1 foci Under Heat Stress In Arabidopsis thaliana. 
出版年 2015
掲載 Plant Cell Physiol. 56:107-115.
班員名 濱田隆宏
著者名 Hamada T, Ueda H, Kawase T, *Hara-Nishimura I 
タイトル Microtubules Contribute to Tubule Elongation and Anchoring of Endoplasmic Reticulum, Resulting in High Network Complexity in Arabidopsis thaliana. 
出版年 2014
掲載 Plant Physiol. 166:1869-1876.
班員名 藤田浩徳
著者名 Fujita H, Aoki S, Kawaguchi M
タイトル Evolutionary dynamics of nitrogen fixation in the Legume–Rhizobia symbiosis. 
出版年 2014
掲載 PLoS ONE 9: e93670.
班員名 藤田浩徳
著者名 Fukushima K, Fujita H, Yamaguchi T, Kawaguchi M, Tsukaya H, *Hasebe M
タイトル Oriented cell division shapes carnivorous pitcher leaves of Sarracenia purpurea. 
出版年 2015
掲載 Nat. Commun. 6:6450.
班員名 藤本仰一
著者名 Kitazawa MS, *Fujimoto K
タイトル A dynamical phyllotaxis model to determine floral organ number.
出版年 2015
掲載 PLoS Comput Biol. 11: e1004145. 
班員名 藤本仰一
著者名 Kitazawa MS, *Fujimoto K
タイトル A developmental basis for stochasticity in floral organ numbers.
出版年 2014
掲載 Front. Plant Sci. 5:545.
班員名 古谷将彦
著者名 Hayashi K, Nakamura S, Fukunaga S, Nishimura T, Jenness MK, Murphy AS, Motose H, Nozaki H, Furutani M, Aoyama T
タイトル Auxin transport sites are visualized in planta using fluorescent auxin analogs.
出版年 2014
掲載 Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 111: 11557-11562.
班員名 前島正義
著者名 Segami S, Makino S, Miyake A, Asaoka M, *Maeshima M
タイトル Dynamics of vacuoles and H+-pyrophosphatase visualized by monomeric green fluorescent protein in Arabidopsis: Artifactual bulbs and native intravacuolar spherical structures.
出版年 2014
掲載 Plant Cell 26: 3416-3434.
班員名 前島正義
著者名 Tanaka N, Fujiwara T, Tomioka R, Krämer U, *Kawachi M, *Maeshima M
タイトル The histidine-rich loop of Arabidopsis vacuolar membrane zinc transporter AtMTP1 is involved in sensing cytosolic level of zinc.
出版年 2015
掲載 Plant Cell Physiol. 56: 510-519.
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